Can we predictt the phenotpe of an individual from DNA ?
Edit Le Floch, CNRGH
14 novembre 2017, 11h, CEA-Saclay, Bat 141, salle andré Bethelot
Le CNRGH s’intéresse à l’étude de la composante génétique dans de nombreuses maladies humaines. Les modifications du génome responsables de cette composante génétique restent souvent difficiles à identifier, notamment dans le cas des maladies les plus courantes qui sont des maladies complexes impliquant de nombreuses variations du génome. L’approche classique en génétique, plutôt adaptée à l’étude des maladies impliquant une seule modification génétique, consiste à tester s’il existe une association statistique entre chaque variation sur le génome et la maladie. Le génome humain étant formé de 3 milliards de nucléotides, cela représente autant de variations potentielles à tester et par conséquent un problème statistique de tests multiples. Au final pour beaucoup de maladies complexes, les modifications génétiques identifiées de cette façon restent peu nombreuses et ne semblent pas expliquer toute la composante génétique suggérée par le degré de transmission de la maladie au sein d’une famille. Les méthodes d’apprentissage statistique multi-variée (machine learning) permettant de combiner les effets de plusieurs variations génétiques semblent donc très prometteuses. Lors de ce séminaire, j’exposerai le problème à résoudre et nos besoins
