L’amélioration ces dernières années des techniques expérimentales en sciences du vivant provoque l’augmentation considérable de la quantité des données brutes mises à disposition de la communauté. Les scientifiques doivent faire face à un véritable déluge de données, hétérogènes et extrêmement volumineuses, pour en extraire de la connaissance. Pour cela ils ont besoin, notamment, d’outils bioinformatiques pertinents et performants, fonctionnant sur des infrastructures informatiques adaptées et de dimensions suffisantes. Pour répondre à ces problématiques, nous explorons depuis quelques années l’utilisation du « cloud computing », le nuage informatique, en Biologie. Pour cela nous avons développé plusieurs services bioinformatiques, qui comprennent des outils bioinformatiques standards (ainsi que des pipelines ou des workflows, et des interfaces graphiques) de la communauté, que nous avons encapsulés et configurés sous la forme de machines virtuelles modèles, des « appliances ». Celles-ci sont alors prêtes à l’emploi, pour un déploiement rapide et à la demande sur une infrastructure de recherche de type cloud. L’avantage de telles machines virtuelles est que leur taille (de l’ordre du giga-octets) est relativement petite, un facteur d’échelle de l’ordre du millier, au regard de la taille des données considérées (de l’ordre du tera-octet). Il est ainsi plus efficace d’amener ces machines au plus près des données et d’y réaliser les analyses, que de déplacer les grandes masses de données. Pour conduire nos expérimentations nous avons également été amenés à mettre en place et exploiter une telle plateforme de cloud académique à destination de la communauté en biologie: le cloud IDB. Ce travail initié à l’Institut de Biologie et Chimie des Protéines (IBCP FR3302 CNRS-Université de Lyon) est maintenant poursuivi au sein de l’Institut Français de Bioinformatique (IFB CNRS UMS3601) dont l’une des missions est de de mettre en place un cloud académique national dédié à la gestion et au traitement des données des sciences de la vie.