Les applications médicales des accélérateurs ont été développées très tôt et sont maintenant très répandues. En particulier, les cyclotrons présentent des avantages qui font que ce type d’accélérateur est très utilisé dans ce domaine. La physique du cyclotron sera abordée ainsi que les caractéristiques de ce type d’accélérateur qui en font un outil particulièrement bien adapté aux applications médicales : protonthérapie ou productions de radioisotopes. Après un bref rappel historique, les cyclotrons utilisés pour ces applications seront décrits. Ces accélérateurs sont maintenant devenus des produits industriels.