Réunion de lancement du GDR Architecture et Dynamique Nucléaire (ADN)

2 mai 2012, 12:00 → 4 mai 2012, 14:30 Europe/Paris

Amphi Durand (Bâtiment Esclangon) (Université Pierre et Marie Curie (UPMC))

(lien vers l'édition 2013)

Le GDR Architecture et Dynamique Nucléaire (ADN), labellisé "réseau thématique" du RNSC, organise du 2 au 4 mai 2012 sa Rencontre d'ouverture à l'Université Pierre et Marie Curie (site Jussieu, bâtiment Esclangon, amphi Durand), Paris.

 

Toutes les équipes partenaires du GDR (il y en a maintenant 73) sont invitées à venir aussi nombreuses que possible et à présenter leur travail. Nous insistons pour qu'au moins un représentant de chaque équipe puisse assister à cette réunion.

Les sessions seront organisées autour de "thématiques" (non exclusives et relativement "poreuses"), dans lesquelles devraient se retrouver  assez naturellement les différentes équipes:
- Organisation du noyau
- Division cellulaire, réplication, réparation, recombinaison ("3R")
- Epigénétique, différenciation cellulaire, développement
- Biotechnologies et systèmes reconstitués
- Haut débit
- Modélisation

L'objectif est de faire émerger des groupes de travail, qui seront a priori plutôt transversaux, impliquant donc plusieurs "thématiques". Dans le jargon des systèmes complexes, ces groupes de travail seront autant de "modules fonctionnels" du réseau d'équipes du GDR.


Lien vers les Colloques de lancement du GDR, Architecture nucléaire et dynamique fonctionnelle des chromosomes : éditions 2009 2010 2011

pour plus d'information : victor@lptmc.jussieu.fr


Comité scientifique:

Geneviève ALMOUZNI (DRCE1 CNRS)
Alain ARNEODO (DR1 CNRS)
Aurélien BANCAUD (CR1 CNRS)                    
Kerstin BYSTRICKY (PU)
Olivier ESPELI (CR1 CNRS)                    
Nicolas FORAY (CR1 INSERM)
Thierry FORNE (DR2 CNRS)                    
Valérie GAUDIN (DR INRA)
Françoise LIVOLANT (DR1 CNRS)                
Marcel MECHALI (DR0 CNRS)
Marie-Claude MARSOLIER-KERGOAT (CR CEA)

Comité d'organisation local : Maria Barbi, Christophe Lavelle, Julien Mozziconacci, Jean-Marc Victor

Site : http://indico.in2p3.fr//event/gdradn


  

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mercredi 2 mai

13:00 → 14:00 Accueil/Repas

accueil des participant avec sandwiches

14:00 → 14:15 Introduction

14:15 → 16:00 session 1 : épigénetique, différenciation cellulaire, développement

7 communications de 15 minutes

14:15 Dynamique nucléaire et pluripotence au cours du développement embryonnaire chez les mammifères

Orateur: Dr Nathalie Beaujean (INRA)

Transparents GDR_Beaujean.pdf

14:30 Benecke

14:45 Dynamique de la chromatine chez Arabidopsis

Orateur: Dr Valérie Gaudin (Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech)

Transparents Gaudin_GDR_2012.pdf

15:00 Rôle de la dynamique de l'architecture chromatinienne dans la régulation de la transcription des gènes

Orateur: Sébastien Huet (Institut de Génétique et du Développement de Rennes)

15:15 The SUMO protease SENP7 is a critical component of pericentric heterochromatin to ensure local HP1 enrichment

Orateur: Dr Jean-Pierre Quivy Quivy (CNRS)

15:30 Cartographie et interactions des sites de liaison à l'ADN des récepteurs aux hormones thyroïdiennes : utilisation de la technologie ChIA-PET

Orateur: Dr Laurent Sachs (UMR 7221 CNRS / MNHN)

15:45 Stress, Cancer et Dynamique de l'Organisation des génomes

Orateur: Prof. Claire VOURC'H (Université)

16:00 → 16:30 coffee break

16:30 → 18:15 session 2 : modélisation

7 communications de 15 minutes

16:30 Equipe Modélisation et imagerie numérique : analyse et modélisation de l’architecture fonctionnelle du noyau chez Arabidopsis thaliana

Orateur: Dr Philippe ANDREY (UPMC et INRA Versailles)

Transparents gdrADN-andrey-2012.05.02.pdf

16:45 Modélisation biophysique de la chromatine

Orateur: Dr Cedric Vaillant (Laboratoire de Physique ENS de Lyon CNRS)

Transparents Vaillant-GdR.pdf

17:00 Dynamique d'expression des gènes pilotée par la géométrie

Orateur: Dr Bob Meyer (LPTMC, Paris)

17:15 Nouveaux outils de simulation pour la modélisation des chromosomes

Orateur: M. Pascal Carrivain (LPTMC)

Transparents colloque_gdr_Carrivain.pdf

17:30 Structure, flexibilité et séquence de l’ADN

Orateur: Dr Brigitte Hartmann (CNRS - ENS de Cachan)

Transparents Hartmann_presentation_GDR_mai_2012.pdf

17:45 Analyse et modélisation spatiales de l'organisation nucléaire

Orateur: Dr Kiên Kiêu (INRA)

Transparents slides_kieu.pdf

18:00 Bioinformatique et biophysique de l'ADN

Orateur: Marie-Claude Marsolier-Kergoat (CEA/Saclay)

Transparents MCMK-AG.pdf

19:00 → 21:00 Diner libre

jeudi 3 mai

09:00 → 09:30 café d'accueil

09:30 → 11:00 session 3 : "3R"

6 communications de 15 minutes

09:30 Cibot

09:45 Modélisation des interactions ADN dans le contexte des nanotechnologies

Orateur: Dr Alain Estève (LAAS-CNRS, Toulouse)

Transparents Esteve-GDR_ADN.pdf

10:00 Ségrégation des chromosomes bactériens

Orateur: Jean-Yves Bouet (CNRS-Université Toulouse III)

10:15 Impact de l’organisation du noyau sur la stabilité du génome

Orateur: Dr Karine Dubrana (IRCM-CEA)

10:30 Cohesion des chromatides soeurs

Orateur: Dr Olivier Espeli (CGM - CNRS)

10:45 Dynamique du Génome et Replication

Orateur: Dr Marcel Méchali (Institut de Génétique Humaine)

11:00 → 11:30 coffee break

11:30 → 12:45 session 4 : biotechnologies, systèmes reconstitués

5 communications de 15 minutes

11:30 Nouvelles technologies micro- et nano-fluidique pour l’étude du chromosome in vivo et in vitro

Orateur: Aurélien Bancaud (LAAS-CNRS)

11:45 Lavelle

12:00 Rôle de la chromatine, de la transcription et de cofacteurs cellulaires dans l’intégration rétrovirale

Orateur: Dr Marc Lavigne (Institut Pasteur, CNRS, ENS)

12:15 abstract Livolant LPS

Orateur: Françoise Livolant (LPS)

12:30 Etude des dynamiques et Interactions de complexes intranucléaires par microscopie

Orateur: Dr Bernard Vandenbunder (IRI)

12:45 → 14:15 Dejeuner

14:15 → 16:00 session 5 : organisation du noyau

7 communications de 15 minutes

14:15 Dynamique et organisation des chromosomes

Orateur: Hicham Saad (Université Paul Sabatier Toulouse III - CNRS, LBME)

14:30 Organisation nucléaire de la cellule épithéliale mammaire - Localisation de gènes dont l’expression est régulée lors du développement

Orateur: Dr Clémence Kress (INRA)

14:45 Séquences d'ADN répétées et organisation du génome

Orateur: Dr Christophe Escudé (Muséum National d'Histoire Naturelle)

15:00 Organisation fonctionnelle des chromosomes chez la levure : Points de vue dynamiques au sein de cellules uniques

Orateur: Dr Emmanuelle Fabre (CNRS)

15:15 Organisation et dynamique nucléaire de la synthèse des constituants du ribosome

Orateur: Dr Olivier Gadal (CNRS)

15:30 Compartimentation et dynamique des fonctions nucléaires

Orateur: Dr Angela Taddei (CNRS/Institut Curie)

15:45 Architecture nucléaire

Orateur: Mme Yvette Lahbib_Mansais (INRA toulouse)

16:00 → 16:30 Coffee break

16:30 → 18:00 session 6 : haut débit et "3R"

5 communications de 15 minutes

16:30 Régulation transcriptionnelle et réplication du génome chez E.coli

Orateur: Dr Bianca Sclavi (LBPA, UMR 8113)

16:45 Insulator-based Functional/Structural partionning of the Genome

Orateur: Dr Olivier Cuvier (Inserm / CNRS)

17:00 Architecture génomique et contrôle épigénétique

Orateur: Dr Thierry Forné (Institut de Génétique Moléculaire Montpellier)

17:15 Koszul

17:30 Les histones et leurs modifications in vivo

Orateur: Christophe THIRIET (CNRS)

18:00 → 19:00 Réunion du comité scientifique du GDR

19:30 → 20:30 Diner social

vendredi 4 mai

09:00 → 09:30 café d'accueil

09:30 → 11:00 session 7 : modélisation

7 contributions de 15 minutes

09:30 Modeling, data analysis and simulations of stochastic particles in a confined environment

Orateur: David Holcman (ENS)

09:45 Relation entre plan du génome, expression des gènes et conformation du chromosome chez les microorganismes

Orateur: François Kepes (CNRS, Genopole)

10:00 Régulation du Remodelage de la Chromatine

Orateur: Dr Ralf Blossey Blossey (CNRS)

10:15 Modèle dynamique du nucléosome: rôle du linker histone et fluctuations

Orateur: M. Sam Meyer (ENS Lyon)

10:30 Modélisation de l'organisation 3D des génomes a partir de données issues du séquencage haut débit

Orateur: Dr Julien Mozziconacci (lptmc)

10:45 Génomique multi-échelle des fonctions nucléaires

Orateur: Dr Benjamin Audit (Laboratoire de Physique de l'ENS de Lyon - UMR 5672 CNRS / ENS de Lyon)

11:00 → 11:30 Coffee break

11:30 → 12:45 session 8 : organisation du noyau et "3R"

5 communications de 15 minutes

11:30 Perinucleolar relocalization of translocated genes in the nuclear space leads to their nucleolin-dependent activation: a common mechanism in lymphomas?

Orateur: Dr Yegor Vassetzky (CNRS UMR8126)

11:45 Zimmer

12:05 Rimsky

12:25 Foray

12:45 → 13:00 Conclusion

13:00 → 13:45 Buffet de départ