L'organisation du Système Solaire et la description des mouvements qui le caractérisent ont constitué le cœur de l'astronomie pendant de siècles depuis l'antiquité. Cette science appelée Mécanique Céleste qui repose sur la théorie de la gravitation a connu son heure de gloire au XIXe siècle, avant de passer au second plan devant l'essor de l'astrophysique. Elle est aujourd'hui en plein renouveau grâce aux progrès des observations, et des capacités de calcul sur ordinateur, qui permettent d'explorer numériquement le caractère intrinsèquement chaotique de ces mouvements. J'exposerai d'abord l'architecture du Système Solaire dans l'état de nos connaissances d'aujourd'hui. Je décrirai la théorie des perturbations entre planètes et son lien avec la mécanique Hamitonienne classique. Je montrerai qu'en général, les perturbations ne détruisent pas la stabilité de l'ensemble, mais que certains phénomènes de résonances (Kozai, moyen mouvement...) peuvent affecter localement l'évolution du système : instabilités, génération d'astéroïdes géocroiseurs potentiellement dangereux, effets sur l'orbite de la Terre et son axe de rotation, etc... Je présente quelques théories récentes comme l'instabilité dite "modèle de Nice" au début de l'histoire du Système Solaire, et la récente hypothèse d'une 9ème planète à l'extérieur du Système. Enfin, je fais un tour d'horizon des configurations dynamiques rencontrées dans les milliers de systèmes extrasolaires connus aujourd'hui, pour arriver à la conclusion que la configuration de notre Système Solaire est très loin de représenter la diversité des architectures rencontrées.